論文出處：Precision Metagenomics: Rapid Metagenomic Analyses for Infectious Disease Diagnostics and Public Health Surveillance. J Biochem Tech. 2017;28(1):40-45.
中文部分摘要：次代定序(next generation sequencing, NGS) 技術帶來精準醫療的時代，改變我們治療癌症病人和診斷疾病的方式。伴隨地，這些技術的出現在過去十年中誘發微生物醫學和多源性基因體學研究(metagenomics studies)的激增，其中許多研究集中在傳染病的發生與傳播的關鍵：宿主 – 基因 – 微生物相互作用，並瞭解維護健康的關鍵。隨之，發現有關傳染病病因的更多信息，在治療和快速診斷方法具轉譯潛力多源性基因體學研究NGS變得越來越明確。所以，在此研究，我們提供一個健全的草案，用於臨床檢體的跨各種定序平台的實施與應用的“精準多源性基因體學”。這樣的管道整合DNA / RNA萃取，實驗室製備，定序和生物信息學(bioinformatics)分析，用於分層分類，抗菌性（AMR）標記篩選和功能分析（含生化和代謝途徑）。此外，管道有三：STAT24小時內的結果;綜合深度分析，需要5〜7 天，則提供抗菌藥物信息;標靶對特定病原體進行更敏感的分析，也需要5-7 天。最後，此草案同時也須面對未來挑戰。